La croissance du nombre d’établissements scolaires mettant en œuvre une démarche Eco-Ecole (le programme a accueilli son 1000ème établissement à la rentrée 2009) a conduit la FEEE à identifier des personnes et des structures à même de compléter l’accompagnement national. 

Les Relais locaux accompagnent les établissements scolaires présents sur leur périmètre, dans la mise en œuvre de la méthodologie Eco-Ecole et s’assurent de leur bonne compréhension des objectifs du programme. Ils peuvent aider les porteurs de projets à définir leurs priorités, à identifier des partenaires, à faciliter le travail des comités de suivi des projets et leur fonctionnement, à favoriser l’implication des élèves dans les projet et à apporter des réponses pratiques (calendrier, préparation des demandes de la labellisation...).

Ils sont formés par la FEEE à la démarche Eco-Ecole, aux objectifs et aux grandes étapes du programme, pour apporter un accompagnement de proximité aux porteurs de projets.

Chaque structure Relais intervient sur un périmètre bien précis, défini lors du conventionnement avec la FEEE. Ce périmètre peut être à l'échelle d'un département, d'une communauté de commune ou d'une commune, d'un pays, etc.